Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
EHD3Q9NZN3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms