Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CWC25Q9NXE8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms