Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLN6Q9NWW5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms