Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCLQ9NW38 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCLQ9NW38 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCLQ9NW38 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCLQ9NW38 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCLQ9NW38 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCLQ9NW38 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCLQ9NW38 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCLQ9NW38 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCLQ9NW38 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCLQ9NW38 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCLQ9NW38 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCLQ9NW38 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCLQ9NW38 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCLQ9NW38 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCLQ9NW38 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCLQ9NW38 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCLQ9NW38 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FANCLQ9NW38 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms