Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATAD3AQ9NVI7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms