Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms