Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL1Q9NSC2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL1Q9NSC2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms