Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms