Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DUOX2Q9NRD8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms