Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM10Q9NQV6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM10Q9NQV6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms