Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms