Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms