Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ31

AKIP1, A-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKIP1Q9NQ31 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AKIP1Q9NQ31 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AKIP1Q9NQ31 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AKIP1Q9NQ31 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AKIP1Q9NQ31 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms