Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6CQ9HCJ0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNRC6CQ9HCJ0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms