Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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