Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX5Q9H2C1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX5Q9H2C1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX5Q9H2C1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX5Q9H2C1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX5Q9H2C1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX5Q9H2C1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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