Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms