Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms