Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPESC1Q9GZL8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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