Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SHANK3Q9BYB0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SHANK3Q9BYB0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SHANK3Q9BYB0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SHANK3Q9BYB0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SHANK3Q9BYB0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHANK3Q9BYB0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHANK3Q9BYB0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHANK3Q9BYB0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHANK3Q9BYB0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHANK3Q9BYB0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHANK3Q9BYB0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SHANK3Q9BYB0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHANK3Q9BYB0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms