Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms