Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCGF1Q9BSM1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms