Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A3Q9BRY0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC39A3Q9BRY0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms