Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC22CQ9BRL7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.5 ms