Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms