Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms