Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BPIFA3Q9BQP9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms