Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms