Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 AC068205.1-201ENST00000526615 689 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 AC090515.5-201ENST00000560378 526 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms