Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMTK3Q96Q04 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms