Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms