Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRC1Q96M27 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRC1Q96M27 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms