Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EAF1Q96JC9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms