Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIC2Q96JB3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms