Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms