Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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TRIM63Q969Q1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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TRIM63Q969Q1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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TRIM63Q969Q1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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TRIM63Q969Q1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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TRIM63Q969Q1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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TRIM63Q969Q1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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TRIM63Q969Q1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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TRIM63Q969Q1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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TRIM63Q969Q1 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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TRIM63Q969Q1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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