Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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