Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms