Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSH3Q8TE77 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms