Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms