Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00299Q6ZSB3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms