Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CD109Q6YHK3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms