Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC171Q6TFL3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms