Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms