Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL35Q6PF15 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL35Q6PF15 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms