Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6P435 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6P435 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6P435 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6P435 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6P435 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6P435 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6P435 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6P435 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6P435 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6P435 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6P435 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6P435 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6P435 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6P435 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6P435 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6P435 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6P435 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6P435 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6P435 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6P435 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6P435 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6P435 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6P435 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6P435 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6P435 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6P435 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6P435 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6P435 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6P435 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q6P435 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q6P435 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q6P435 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q6P435 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q6P435 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q6P435 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q6P435 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6P435 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6P435 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6P435 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6P435 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6P435 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6P435 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6P435 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6P435 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6P435 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6P435 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6P435 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6P435 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6P435 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6P435 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6P435 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6P435 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6P435 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6P435 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6P435 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6P435 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6P435 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6P435 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6P435 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6P435 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6P435 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6P435 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms