Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYSMD4Q5XG99 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYSMD4Q5XG99 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYSMD4Q5XG99 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYSMD4Q5XG99 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYSMD4Q5XG99 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYSMD4Q5XG99 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYSMD4Q5XG99 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYSMD4Q5XG99 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYSMD4Q5XG99 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYSMD4Q5XG99 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LYSMD4Q5XG99 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LYSMD4Q5XG99 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LYSMD4Q5XG99 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
LYSMD4Q5XG99 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LYSMD4Q5XG99 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LYSMD4Q5XG99 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LYSMD4Q5XG99 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LYSMD4Q5XG99 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYSMD4Q5XG99 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms