Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms