Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECM29Q5VYK3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms