Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms